Lọc sinh học là điều cần thiết cho hệ sinh thái ao hồ khỏe mạnh. Các hệ thống này sử dụng vi khuẩn có lợi để phân hủy chất thải của cá, thức ăn thừa và mảnh vụn thực vật, chuyển đổi amoniac có hại thành nitrit và sau đó là nitrat, ít độc hơn đối với cá.
